O organograma apresenta a estrutura organizacional da FAI • UFSCar. A instituição possui dois órgãos superiores: o Conselho Deliberativo e o Conselho Fiscal. Abaixo deles, encontra-se a Diretoria, que se subdivide em três áreas específicas: Diretoria Executiva, Diretoria Institucional e Diretoria de Fomento à Cultura e Comunicação.

Na base da estrutura, observam-se oito departamentos operacionais: 

    - Secretaria Institucional
    - Assessoria Jurídica
    - Projetos
    - Administração
    - Fomentos
    - Finanças e Contabilidade
    - Tecnologia da Informação 
    - Assessoria de Comunicação Institucional.

Esta estrutura proporciona uma organização voltada para a gestão institucional, com foco em projetos e fomentos, sustentada por áreas técnicas e administrativas.